English term
working X out
Proposed translations
Austria
Helping to communicate across cultures
Native in: English 
, Spanish
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llevando a cabo/cumpliendo/desempeñando
En cuanto a Romanos 8:28, creo que es ese contexto sí se refiere a que Dios esta trabajando/arreglando/disponiendo todas las cosas para bien (esta última opción es similar a la versión NVI).
Espero que sea de ayuda!
Ahora bien, sabemos que Dios dispone todas las cosas para el bien de quienes lo aman (Rom. 8:28 NVI)
Argentina
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Native in: Spanish 
Works in: English to Spanish
Desarrollando (Dios estaba desarrollando Su plan...)
France
FR>ES Marketing/Environment/Literature
Native in: Spanish (Variants: Rioplatense, Standard-Spain, Argentine)
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[Dios estaba] elaborando [un plan perfecto para José]
Brazil
IT/Gaming/Lit Transcreator & Localizator
Native in: Spanish (Variants: Argentine, Venezuelan, Dominican, Mexican, US, Cuban, Latin American, Colombian, Uruguayan) , English (Variants: Canadian, US)
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Dios estaba *preparando* plan perfecto para José. / Dios estaba *preparando* la via para José.
Alternativamente, tambien puedes cambiar *su plan* por "la via* para más poeticamente hablar del futuro que Dios prepara pars José.
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Note added at 4 hrs (2020-03-10 09:26:30 GMT)
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Dios estaba *preparando* SU plan perfecto para José. (Disculpa por el typo)
Mexico
Confianza, certeza, creatividad.
Native in: Spanish (Variant: Mexican)
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Discussion
De manera más fluida tal vez por ejemplo "dar cumpliento", en tanto que ejecutar. También "consumar".
Así, en función del mayor contexto,
Dios consumaba Su perfecto plan para José.
Dios daba cumplimiento a Su plan perfecto para José.